Výbor řídí společnost mezi valnými hromadami: schvaluje plány činnosti a zprávy, volí předsednictvo a rozhoduje o odvoláních ve věcech členství. Je volen na tři roky, současné složení platí pro období 2024–2027. Každodenní chod zajišťuje předsednictvo, které se schází zhruba šestkrát ročně, přijímá nové členy a připravuje podklady pro výbor.
Předsednictvo

MUDr. Luca Ernesto Vannucci, Ph.D.předsedaMikrobiologický ústav AV ČR
Prof. PharmDr. Jitka Palich Fučíková, Ph.D.místopředsedkyněÚstav imunologie 2. LF UK a FN Motol; Sotio Biotech

Prof. MUDr. Anna Šedivá, DSc.místopředsedkyněÚstav imunologie 2. LF UK a FN Motol

RNDr. Dominik Filipp, CSc.vědecký tajemníkÚstav molekulární genetiky AV ČR

MUDr. Miloslav Kverka, Ph.D.hospodářMikrobiologický ústav AV ČR
Prof. MUDr. Mgr. Milan Raška, Ph.D.kontrolorÚstav imunologie FN Olomouc a LF UP
Členové výboru
Sekretariát
Stálá sekretářka společnosti je Jindra Emmerová. Obracejte se na ni s členskými záležitostmi, přihláškami a dotazy na e-mail cis@immunology.cz. Adresa sekretariátu: Vídeňská 1083, 142 20 Praha 4.